在“AI/ML+結構生物學”快速融合的浪潮下,佰翱得(Biortus)8月11日正式發(fā)布其結構與AI/ML融合的生物計算平臺。該平臺集合蛋白設計、抗體優(yōu)化與苗頭化合物發(fā)現(xiàn)三大核心能力,打造了從序列生成到實驗驗證的研發(fā)閉環(huán),助力生物醫(yī)藥研發(fā)效率倍增,現(xiàn)已面向全球合作伙伴開放。
技術突破:結構解析+AI/ML建模雙引擎驅(qū)動
依托全球頂尖的X射線晶體學與冷凍電鏡平臺,佰翱得將高分辨率結構解析能力與AI/ML預測模型深度耦合,打造從序列生成、結構驗證、功能篩選到hit發(fā)現(xiàn) 的全流程智能平臺。該平臺為酶工程、抗體優(yōu)化與早期藥物發(fā)現(xiàn)提供真正可交付、可轉(zhuǎn)化 的一站式解決方案。
佰翱得自建“萬核×百卡”級高性能計算中心 ,構筑業(yè)內(nèi)領先的AI/ML蛋白設計基礎設施,全面驅(qū)動結構與功能的計算探索與迭代。平臺集成AlphaFold2、Chai-1、Bolt-2、Protenix、MD等前沿模型 ,覆蓋結構預測、序列生成、構象優(yōu)化與分子建模全過程。同時,平臺內(nèi)建超大規(guī)模分子虛擬篩選系統(tǒng) 與自研數(shù)據(jù)庫體系,支持億級分子虛擬篩選 ,為結構驅(qū)動的生物分子研發(fā)注入強大動力,全面滿足從科研探索到商業(yè)交付的全場景需求。
產(chǎn)業(yè)級成果:三大場景驗證平臺效能
借助結構與AI/ML融合的強大技術平臺,佰翱得已在多個蛋白設計與藥物研發(fā)場景取得顯著成果,包括工業(yè)酶熱穩(wěn)定性及活性提升、高親和力抗體優(yōu)化以及藥靶Hit的精準命中。
場景一:酶工程改造,極端環(huán)境活性提升20倍
佰翱得 AI/ML驅(qū)動的結構與蛋白設計平臺已成功完成多個酶分子熱穩(wěn)定性與活性雙重優(yōu)化項目,顯著提升工業(yè)應用價值。
案例: TEVp系列蛋白設計改造
通過結構分析+序列設計協(xié)同優(yōu)化,設計精準對接活性位點與保守殘基,成功構建BioTEVp1等高性能突變體。在高堿性、高變性劑極端環(huán)境中,該突變體依然保持完整活性。
熱穩(wěn)定性(Tm)提升達36°C,活性提升20倍!
在1M NaOH / 8M Urea等極端條件下表現(xiàn)出優(yōu)異耐受性
案例: 14天從設計到實驗驗證,bdSENP1展示平臺極速閉環(huán)能力!
在佰翱得智能蛋白設計平臺加速驅(qū)動下,2周內(nèi)即完成bdSENP1酶突變體的蛋白設計及實驗驗證,充分體現(xiàn)了平臺在“結構驅(qū)動設計+快速實驗驗證”上的閉環(huán)優(yōu)勢,大幅提升蛋白工程效率上限。
熱穩(wěn)定性提升達30°C,顯著增強在極端條件下的結構耐受性;
酶活性提升超過500%,反應效率成倍增長。
場景二:AI/ML精準設計抗體,結構還原度達原子級
佰翱得抗體設計平臺融合結構生物學解析能力與AI/ML智能建模技術,從抗原表位出發(fā),自動完成抗體結構的精準設計與結合模式預測。
案例: 通過AI/ML建模設計出的抗原-納米抗體復合物,經(jīng) X 射線晶體學解析驗證后,結構高度吻合(RMSD<1 ?),印證了結構預測的高準確性。
關鍵互作界面保持高度一致,構象精準、結合合理;
充分驗證平臺在“構象預測+界面建?!狈矫娴臏蚀_性與產(chǎn)業(yè)實用價值。
這標志著佰翱得平臺不僅能“生成結合結構”,更能真實還原結合狀態(tài) ,為抗體親和力優(yōu)化與功能驗證提供強大支持。
場景三:藥物發(fā)現(xiàn),4周鎖定16.4 nM高親和力化合物
佰翱得整合結構解析、AI/ML虛擬篩選與實驗驗證三大核心能力,構建出高效、可擴展的苗頭化合物發(fā)現(xiàn)流程。通過智能對接預測與高通量TRIC篩選聯(lián)動,快速識別具備成藥潛力的初始片段,為小分子藥物研發(fā)提供強有力的起點支持。
案例: GPCR靶點片段化合物發(fā)現(xiàn)
4周內(nèi)完成從初始對接到命中驗證,充分展現(xiàn)出佰翱得平臺在“虛擬+實驗”融合策略下的高效率與高準確性,為新藥靶點的hit-to-lead奠定堅實基礎。
自建片段庫開展AI/ML輔助虛擬篩選,2天內(nèi)快速鎖定60個Top hit片段;
1周內(nèi)成功識別出多個高親和力hit,KD最低達到16.4 nM
平臺價值:重構生物分子研發(fā)范式
“傳統(tǒng)蛋白設計需數(shù)月迭代,而我們通過結構解析與AI/ML的實時反饋循環(huán),成功將研發(fā)周期壓縮50%以上?!卑郯康眉夹g負責人表示。該平臺已服務多家頂尖藥企,在工業(yè)酶改造、腫瘤抗體開發(fā)及難成藥靶點攻克中取得突破性進展。
未來,佰翱得將持續(xù)深化結構與AI/ML融合的研發(fā)平臺建設,為生物分子設計注入可驗證、可交付、可產(chǎn)業(yè)化的新動能,加速推動生物醫(yī)藥從科研探索向產(chǎn)業(yè)交付轉(zhuǎn)化。
關于佰翱得
佰翱得是一家全球領先的獨立CRO,其成熟的一體化平臺提供豐富的模塊化服務,包括可溶性蛋白和膜蛋白生產(chǎn)、分析和篩選,以及基于結構的微晶電子衍射、冷凍電鏡和X射線晶體學等服務。同時佰翱得現(xiàn)在也提供現(xiàn)成的目錄蛋白產(chǎn)品,從而全面加速藥物發(fā)現(xiàn)。
自2009年以來,佰翱得已與全球各領域的研究機構、生物技術公司和制藥公司建立了眾多合作關系,其業(yè)務遍布中國和波士頓。
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